司法鉴定委托协议书不交，鉴定不一定有效。具体分析如下：

1. 协议书的重要性：司法鉴定委托协议书是委托人与鉴定机构之间就鉴定事项、鉴定费用、鉴定责任等进行的约定，是双方权利义务的明确。它不仅是委托关系的证明，也是后续鉴定工作开展的依据。

2. 不交协议书的影响：

   • 鉴定机构可能拒绝鉴定：如果委托人未提交司法鉴定委托协议书，鉴定机构可能会认为委托关系未明确，从而拒绝进行鉴定。
   • 鉴定结果可能不被认可：即使鉴定机构在没有委托书的情况下进行了鉴定，但由于缺乏合法的委托关系证明，鉴定结果可能在法律程序中被质疑或不被认可。

3. 特殊情况：

   • 如果双方有口头约定或其他形式的委托证明，且能够证明委托关系的存在，那么鉴定机构可能会根据这些证明进行鉴定，但这种情况较为少见，且风险较大。
   • 在某些紧急情况下，为了尽快获取鉴定结果，鉴定机构可能会在没有委托书的情况下先进行鉴定，但后续仍需要补充相关委托手续以确保鉴定结果的合法性。

4. 法律建议：

   • 为了确保鉴定的有效性和合法性，委托人应当严格按照鉴定机构的要求提交司法鉴定委托协议书。
   • 如果因特殊原因无法及时提交协议书，应当与鉴定机构进行沟通，并尽快补充相关手续。
   • 如果鉴定结果因未提交协议书而被质疑或不被认可，委托人可能需要承担相应的法律责任或面临重新鉴定的风险。

综上所述，司法鉴定委托协议书是确保鉴定有效性和合法性的重要文件，委托人应当予以重视并妥善保管。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。