在签订了购房合同的同时又签订了回购协议的情况下，双方的法律关系可以从以下几个角度进行认定：
一、合同性质与独立性
购房合同：这是一份典型的房屋买卖合同，其中明确了买卖双方关于房屋交易的基本权利义务，如房屋价格、交付时间、付款方式等。购房合同一旦成立并生效，即对双方具有法律约束力。
回购协议：回购协议则是一份附条件的合同，它约定了在特定条件下（如一定期限后、特定事件发生等），卖方有权或必须回购已售出的房屋。回购协议通常作为购房合同的补充或附件，但其本身也具有独立性，即其效力不完全依赖于购房合同。
二、法律关系的认定
买卖关系：基于购房合同，双方首先建立了房屋买卖的法律关系。买方负有支付购房款的义务，卖方负有交付房屋并转移所有权的义务。
附条件的回购关系：回购协议的签订，在买卖双方之间又增加了一层附条件的回购关系。如果回购协议中约定的条件成就，卖方将承担回购房屋的义务，而买方则享有要求卖方回购的权利。
合同间的联系与独立：虽然购房合同与回购协议在内容上有所关联，但它们各自具有独立的法律地位。购房合同的履行不影响回购协议的效力，反之亦然。除非双方在合同中明确约定了相互之间的依赖关系，否则应分别对待。
三、法律后果与建议
合同履行：在双方均按约履行的情况下，购房合同与回购协议将分别得到履行。如果回购条件成就，卖方应按回购协议履行回购义务；如果回购条件未成就，则购房合同继续有效，双方按购房合同的约定履行。
纠纷处理：如果因购房合同或回购协议产生纠纷，双方应首先通过友好协商解决。协商不成的，可以依据合同中的争议解决条款（如仲裁或诉讼）寻求法律救济。
风险防范：在签订购房合同与回购协议时，双方应充分了解并明确各自的权利义务，特别是回购条件、回购价格、违约责任等关键条款。同时，建议咨询专业律师进行合同审查，以确保合同的合法性和有效性。
综上所述，签订了购房合同同时又签订了回购协议的情况下，双方的法律关系应基于合同的具体内容来认定。在合同履行过程中，双方应严格遵守合同约定，并妥善处理可能出现的纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。