针对您提出的“合同与中标文件内容有差异”的问题，以下是我的详细解答：
核心结论：当合同与中标文件内容存在差异时，通常应以招标文件为准，但具体还需根据实际情况和法律法规进行综合判断。
法律解释：
法律法规依据：
- 根据《中华人民共和国招标投标法》第四十六条，招标人和中标人应当自中标通知书发出之日起三十日内，按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同。招标人和中标人不得再行订立背离合同实质性内容的其他协议。
- 《中华人民共和国招标投标法实施条例》第五十七条也明确规定，招标人和中标人应当依照招标投标法和本条例的规定签订书面合同，合同的标的、价款、质量、履行期限等主要条款应当与招标文件和中标人的投标文件的内容一致。招标人和中标人不得再行订立背离合同实质性内容的其他协议。
司法实践：
- 在司法实践中，若合同与招标文件不一致，法院往往支持以招标文件作为结算或执行的依据。这是因为招标文件是公开、公平、公正竞争的基础，也是合同订立的重要依据。
- 然而，也存在特殊情况。例如，在合同履行过程中出现了给当事方造成巨大损失、合同条款显失公平等适用于情势变更的特殊情况，法院可能会根据实际情况作出不同的判决。
建议与注意事项：
招标人角度：
- 在项目策划阶段应做足准备，明确需求，避免后期频繁变更。
- 编制招标文件时应合理分配风险，拟定合同条款时应当保持细微谨慎的态度，充分考虑与招标文件的一致性。
- 给予投标人充分的答疑时间，确保投标人对招标文件有充分理解。
投标人角度：
- 在投标阶段应认真审查招标文件及相关的配套文件，若发现问题及时在投标答疑会提出并解决。
- 签订合同时应详细比对招投标文件，确保合同与招投标文件内容一致。
纠纷处理：
- 若发生合同纠纷，首先应尝试通过友好协商解决。
- 若协商无果，可寻求法律援助或提起诉讼，根据法律法规和实际情况维护自身权益。
综上所述，当合同与中标文件内容存在差异时，应首先以招标文件为准。但具体处理还需根据实际情况和法律法规进行综合判断。如有进一步疑问或需要法律帮助，请随时向我咨询。