企业土地面积有变化，通常应办理变更登记，而非终止变更。具体分析如下：

一. 变更登记的依据

• 根据《土地管理法》第十二条：“依法改变土地权属和用途的，应当办理土地变更登记手续”。当企业土地面积发生变化时，意味着土地的使用状况或权属可能发生了变更，因此需要按照法律规定办理变更登记。

二. 变更与终止变更的区别

1. 变更登记：是指因土地权利人发生改变，或者因土地权利人姓名或者名称、地址和土地用途等内容发生变更而进行的登记。在企业土地面积有变化的情况下，通常属于土地使用状况的变更，因此需要办理变更登记。
2. 终止变更：通常指的是某种变更行为的结束或取消，但在土地管理的语境中，并不常见“终止变更”的表述。土地面积的变更一旦发生，就需要通过变更登记来确认新的土地状况，而不是终止变更。

三. 实际操作建议

• 当企业发现土地面积有变化时，应及时向当地土地管理部门咨询并办理变更登记手续，以确保土地权属和使用状况的合法性。同时，也需要关注土地面积变化是否涉及土地使用权的转让、出租等交易行为，以及是否需要缴纳相关税费等问题。

我建议企业在发现土地面积有变化时，应尽快启动变更登记程序，以确保自身权益的合法性和稳定性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。