在款项未结清且因股权变更需要终止工程合同的情况下，终止协议的撰写应严谨且全面，以确保双方权益得到妥善保护。以下是一份终止协议的基本框架和要点，供您参考：

1. 协议标题：

   • 明确标注为“工程合同终止协议”。

2. 协议双方信息：

   • 列出原合同双方的全称、注册地址、法定代表人或授权代表等基本信息。

3. 原合同概述：

   • 简要描述原工程合同的基本内容，包括合同编号、签订日期、工程名称、工程地点、合同总价等。

4. 终止原因：

   • 明确说明因股权变更导致合同无法继续履行，以及款项未结清的具体情况。

5. 款项结算：

   • 详细列明已完成的工程量、已支付的款项、未支付的款项及支付方式、时间等，确保双方对款项结算无异议。
   • 如存在争议，应约定争议解决机制，如协商、调解、仲裁或诉讼等。

6. 合同终止后的义务：

   • 双方应明确在合同终止后需履行的义务，如保密义务、资料交接、现场清理等。
   • 对于因合同终止可能产生的损失，应明确责任承担方式。

7. 违约责任：

   • 约定任何一方违反本协议应承担的违约责任，包括但不限于赔偿损失、支付违约金等。

8. 争议解决：

   • 选择适用的法律及争议解决方式，如仲裁或诉讼，并明确仲裁机构或法院的名称及地点。

9. 协议生效与份数：

   • 明确本协议自双方签字盖章之日起生效，并约定协议的份数及双方各执的份数。

10. 其他条款：

    • 根据具体情况，可添加其他双方认为必要的条款，如保密协议、不可抗力条款等。

在撰写终止协议时，请务必确保内容的准确性和全面性，避免遗漏重要事项。同时，建议双方在签署前充分沟通并协商，以确保协议的有效性和可执行性。如有任何疑问或需要进一步的法律支持，请随时向我咨询。