非法占用耕地当事人已办理农用地转用，仍可能追究责任。具体分析如下：

1. 已办理农用地转用的含义：

   • 农用地转用，是指将农用地（如耕地、林地、草地等）转变为建设用地或其他非农业用途的过程。
   • 办理农用地转用手续，通常意味着获得了相关政府部门的批准，将农用地合法地转变为其他用途。

2. 非法占用耕地的定义：

   • 非法占用耕地，通常指的是未经批准或违反规定占用耕地，进行非农业活动的行为。
   • 这种行为可能违反了土地管理法规，并可能构成违法行为。

3. 是否追究责任的分析：

   • 如果当事人在占用耕地之前已经办理了合法的农用地转用手续：那么其占用行为在形式上可能是合法的，但还需考虑其他因素，如是否按照批准的范围、用途和期限使用土地等。
   • 如果当事人在办理农用地转用手续后，未按照批准的范围、用途或期限使用土地：或者存在其他违法行为（如超占面积、改变土地用途等），那么相关部门仍可能依法追究其责任。
   • 如果当事人在办理农用地转用手续时存在欺诈、伪造材料等违法行为：那么其占用的耕地将被视为非法占用，并可能面临严重的法律后果。

4. 法律后果：

   • 如果被认定为非法占用耕地，当事人可能需要承担行政责任（如罚款、责令恢复原状等），甚至可能构成犯罪并承担刑事责任。

综上所述，即使当事人已经办理了农用地转用手续，但如果存在违法行为或未按照批准的要求使用土地，仍可能面临法律追究。因此，建议当事人在占用耕地前务必确保已经获得了合法的批准，并严格按照批准的要求使用土地。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。