旅店业特种行业许可证在同一小区不同楼栋是否可以，需具体看当地公安机关的相关规定。

一. 特种行业许可证的颁发与管理

1. 根据《旅馆业治安管理办法》第四条规定，申请开办旅馆，应经主管部门审查批准，经当地公安机关签署意见，向工商行政管理部门申请登记，领取营业执照后，方准开业。这一条款说明了旅馆业的开业需要经过多个部门的审批，其中包括公安机关。
2. 特种行业许可证的颁发和管理通常遵循属地管理原则，即由所在地的公安机关负责。因此，关于同一小区不同楼栋是否可以持有同一个特种行业许可证，关键在于当地公安机关的具体规定。

二. 实际操作中的考虑因素

1. 地址的明确性：特种行业许可证上通常会注明具体的经营地址。如果同一小区内的不同楼栋被视为不同的经营地址，则可能需要分别申请许可证。
2. 安全与管理：公安机关在颁发许可证时，会考虑旅馆的安全和管理措施。如果同一小区内的不同楼栋在管理和安全上能够保持一致性，且符合相关规定，那么有可能获得许可。
3. 当地政策与规定：不同地区的公安机关可能根据当地实际情况制定不同的政策和规定。因此，在具体操作前，建议咨询当地公安机关或相关部门，了解具体的规定和要求。

我的观点：旅店业特种行业许可证在同一小区不同楼栋是否可以，并不是一个绝对的问题，而是需要根据当地公安机关的具体规定来确定。在实际操作中，建议首先咨询当地公安机关或相关部门，了解具体的政策和规定，以确保合规经营。如有进一步需要，您可以继续咨询我。