当纪检部门提供线索指出组织部干部存在违法犯罪行为时，处理流程通常遵循以下几个步骤，以确保既维护法律尊严，又保障干部的合法权益：

1. 初步核实与立案：

   • 纪检部门提供的线索会首先被相关部门（如纪检监察机关、检察机关等）进行初步核实。这一步骤旨在确认线索的真实性、可靠性和具体性。
   • 如果初步核实表明存在违法犯罪行为的可能，相关部门将依法立案，并启动正式的调查程序。

2. 调查取证：

   • 立案后，调查机关将展开全面、客观、公正的调查，收集相关证据材料。这包括询问证人、调取书证、物证、视听资料等。
   • 调查过程中，会严格遵守法律程序，确保证据的合法性、真实性和关联性。

3. 依法处理：

   • 根据调查取证的结果，如果确认组织部干部确实存在违法犯罪行为，将依法进行处理。这可能包括移送司法机关追究刑事责任、给予党纪政纪处分等。
   • 处理过程中，会充分考虑违法犯罪的性质、情节、社会危害程度以及干部的个人情况等因素，确保处理结果的公正性和合理性。

4. 保障权益：

   • 在整个处理过程中，都会充分保障被调查干部的合法权益。包括知情权、申辩权、申诉权等。
   • 如果被调查干部对处理结果有异议，可以依法提出申诉或复议，相关部门将按照法律程序进行复核和处理。

5. 预防与教育：

   • 处理完毕后，相关部门还会针对案件中暴露出的问题进行深入剖析和总结，制定有效的预防措施和制度完善方案。
   • 同时，加强对组织部干部的法律教育和警示教育，提高他们的法律意识和廉洁自律意识。

综上所述，当纪检部门提供线索指出组织部干部存在违法犯罪行为时，相关部门将依法依规进行处理，确保法律的严肃性和公正性。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。