同性恋代孕孩子的归属问题，需综合考虑代孕协议、孩子生物父母及实际抚养情况等多方面因素。

一. 代孕协议的合法性及影响

1. 代孕协议在中国大陆的合法性：根据《人类辅助生殖技术管理办法》（2001）第三条，医疗机构和医务人员不得实施任何形式的代孕技术。因此，代孕协议在中国大陆通常被视为无效，不具有法律约束力。
2. 代孕协议对孩子归属的影响：尽管代孕协议可能约定了孩子的归属，但由于其违法性，该协议在法律上可能无法得到承认和执行。因此，孩子的归属不能仅凭代孕协议来确定。

二. 孩子生物父母的确定

1. 生物学父亲的确定：在同性恋代孕中，如果使用了其中一方的精子，那么该方通常被视为孩子的生物学父亲。
2. 生物学母亲的确定：代孕母亲在生物学上也是孩子的母亲。然而，在法律上，生物学母亲的身份可能因代孕的违法性而受到质疑。

三. 实际抚养情况的重要性

1. 抚养事实的考虑：在法律上，孩子的实际抚养情况也是确定其归属的重要因素。如果同性恋伴侣中的一方或双方实际上在抚养孩子，并且与孩子建立了深厚的亲子关系，那么这将对孩子的归属产生积极影响。
2. 孩子利益的最大化：在确定孩子的归属时，法院通常会优先考虑孩子的最大利益。这包括孩子的身心健康、成长环境、教育条件等因素。

四. 综合判断与建议

1. 综合考虑多方面因素：同性恋代孕孩子的归属问题涉及多个方面，包括代孕协议的合法性、孩子的生物父母、实际抚养情况等。因此，在确定孩子的归属时，需要综合考虑这些因素。
2. 寻求法律帮助：由于同性恋代孕孩子的归属问题复杂且敏感，我建议相关当事人寻求专业的法律帮助。律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议，并帮助当事人通过法律途径解决争议。

综上所述，同性恋代孕孩子的归属问题是一个复杂而敏感的法律问题。在确定孩子的归属时，需要综合考虑代孕协议的合法性、孩子的生物父母、实际抚养情况以及孩子的最大利益等因素。我建议相关当事人寻求专业的法律帮助，以通过法律途径妥善解决这一问题。如有进一步需要，您可以继续咨询我。