《医疗事故处理条例》在民法典施行后仍然有效。

《医疗事故处理条例》是为正确处理医疗事故，保护患者和医疗机构及其医务人员的合法权益，维护医疗秩序，保障医疗安全，促进医学科学的发展而制定的。该条例自2002年9月1日起施行，并且至今未被废止。因此，在处理医疗事故时，仍然应当依据《医疗事故处理条例》的相关规定进行。

同时，值得注意的是，《民法典》中关于医疗损害责任的规定也是处理医疗事故时的重要法律依据。《民法典》对医疗损害责任进行了详细的规定，包括医疗损害责任的构成要件、赔偿范围、举证责任等，为医患双方提供了更加明确的法律指引。

因此，在处理医疗事故时，应当结合《医疗事故处理条例》和《民法典》的相关规定，进行综合判断和处理。如果患者或其家属认为自身权益受到侵害，建议及时咨询专业法律人士，如我这般的专业律师，以通过法律途径来维护自己的合法权益。