微粒贷协商好了被自动扣款，一般不会影响后期还款。具体分析如下：

一. 自动扣款与协商还款的关系

1. 自动扣款是常规操作：微粒贷作为一种贷款产品，通常会在约定的还款日自动从借款人的绑定银行账户中扣款，这是贷款合同中的常规条款，旨在确保贷款的按时回收。
2. 协商还款不改变扣款方式：即使借款人与微粒贷方面进行了还款协商，如调整还款金额、还款期限等，这通常不会改变原有的自动扣款方式。除非双方明确约定了改变扣款方式，否则自动扣款仍会按照原合同进行。

二. 自动扣款对后期还款的影响

1. 不影响还款计划：只要借款人确保账户中有足够的资金供自动扣款，那么自动扣款本身不会对后期还款产生负面影响。它实际上是帮助借款人按时履行还款义务的一种方式。
2. 可能避免逾期：自动扣款有助于避免因忘记还款而导致的逾期情况，从而保护借款人的信用记录。

三. 建议与注意事项

1. 保持账户资金充足：为了避免因账户资金不足而导致的扣款失败或逾期，借款人应确保在还款日前账户中有足够的资金。
2. 关注还款协议细节：在与微粒贷方面协商还款时，应仔细阅读并理解还款协议的各项条款，特别是关于扣款方式、扣款时间等关键信息。
3. 及时沟通：如果因某种原因无法按时还款或担心自动扣款会出现问题，借款人应及时与微粒贷方面沟通，寻求解决方案。

综上所述，微粒贷协商好了被自动扣款一般不会影响后期还款。但借款人仍需注意保持账户资金充足，并关注还款协议的细节，以确保还款的顺利进行。如有进一步需要，您可以继续咨询我。