关于您因酒店毛巾不干净申请医药赔偿的问题，以下是我的详细解答：
首先，结论上您确实有权向酒店提出医药赔偿的要求，但具体能否获得赔偿以及赔偿的金额，需要根据实际情况和法律规定来判断。
从法律角度来看：
侵权责任：如果酒店的毛巾确实存在卫生问题，导致您使用后出现了身体不适或健康问题，那么酒店作为服务提供者，应当承担相应的侵权责任。根据《民法典》的相关规定，侵权人应当对被侵权人因侵权行为所造成的损害承担赔偿责任。
证据收集：为了支持您的赔偿请求，您需要收集相关证据，如医疗证明、费用发票、酒店毛巾的照片或视频等，以证明您的损害与酒店毛巾的不干净存在因果关系。
赔偿范围：医药赔偿通常包括因治疗疾病所产生的医疗费用、误工费、交通费等合理支出。您需要根据实际损失情况，向酒店提出具体的赔偿要求。
从实践角度来看：
与酒店协商：在发现毛巾不干净并出现健康问题后，您可以首先与酒店进行沟通，表达您的赔偿意愿，并提供相关证据。如果酒店认可您的请求，双方可以协商达成赔偿协议。
投诉举报：如果酒店拒绝赔偿或协商无果，您可以向当地卫生监督部门或消费者协会进行投诉举报，寻求他们的帮助和支持。
法律诉讼：如果以上途径均无法解决问题，您还可以选择通过法律途径来维护自己的权益。您可以向法院提起诉讼，要求酒店承担侵权责任并赔偿您的损失。
综上所述，您因酒店毛巾不干净申请医药赔偿是合理的，但具体能否获得赔偿以及赔偿的金额，需要根据您提供的证据和法律规定来判断。建议您在与酒店协商或采取其他行动前，先咨询专业律师的意见，以确保您的权益得到充分保障。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我提问。