股份制公司犯罪一般由公司登记机关进行处罚。具体分析如下：

一. 处罚部门

• 根据《中华人民共和国公司法》第二百一十条以及《中华人民共和国公司登记管理条例》第七十四条，对于未依法登记为有限责任公司或者股份有限公司，而冒用有限责任公司或者股份有限公司名义的，或者未依法登记为有限责任公司或者股份有限公司的分公司，而冒用有限责任公司或者股份有限公司的分公司名义的行为，由公司登记机关责令改正或者予以取缔，并可以并处十万元以下的罚款。

二. 处罚流程

• 立案阶段：公司登记机关依据监督检查职权或者通过举报、投诉等途径发现违法行为线索后，会组织核查并决定是否立案。
• 调查阶段：案件承办人员会进行调查取证，记录现场检查情况，并允许当事人陈述申辩。
• 审查阶段：案件审查机构会对案件的违法事实、证据等进行审查，并提出处理意见。
• 告知阶段：在送达行政处罚告知书的同时，会告知当事人享有陈述申辩和要求听证等权利。
• 决定阶段：根据案件审理情况和当事人的陈述申辩理由，决定是否予以行政处罚，并制作行政处罚决定书。
• 送达阶段：行政处罚决定书会在规定时间内送达当事人。
• 执行阶段：督促当事人履行生效的行政处罚决定，对逾期不履行的，会依照相关规定申请行政强制执行。

综上所述，股份制公司如果犯罪，特别是涉及冒用公司名义等违法行为，将受到公司登记机关的处罚。如有进一步需要，您可以继续咨询我。