公司应该承担保险公司赔付费用中与你车辆损失相关的部分。针对你的问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 车辆所有权与保险赔付

1. 车辆所有权：既然车辆是你自己的，那么车辆的所有权归你所有。根据物权法的原则，车辆的所有者有权获得因车辆损失而产生的赔偿。
2. 保险赔付原则：保险公司赔付的钱是基于你与保险公司之间的保险合同，用于补偿你因车辆损失而遭受的经济损失。

二. 公司责任

1. 公司造成损失：公司用你的车并导致车辆报废，说明公司对你的车辆造成了实际损失。
2. 赔偿责任：根据《民法典》的相关规定，公司应当对其行为造成的损害承担赔偿责任。因此，公司应当承担保险公司赔付费用中与你车辆损失相关的部分。

三. 保险赔付金的处理

• 既然公司应当承担车辆损失的责任，那么保险公司赔付给你的钱，在本质上是对你车辆损失的补偿。因此，这部分钱应当用于弥补你的损失，而不是由公司无故占有。

综上所述，公司应该承担保险公司赔付费用中与你车辆损失相关的部分。如果公司拒绝承担这部分费用，你可以通过法律途径维护自己的权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。