非法营运被没收违法所得的案例在实际执法中较为常见。以下是一个基于法律条款和常见执法实践的案例分析：
一. 案例概述
某个体在未取得道路运输经营许可的情况下，擅自从事道路客运经营，被县级以上地方人民政府交通运输主管部门查处。经调查，该个体违法所得超过2万元。根据《中华人民共和国道路运输条例》第六十三条的规定，该个体不仅被责令停止经营，还被没收违法所得，并处以违法所得2倍以上10倍以下的罚款。
二. 法律依据与分析
非法营运的定义与处罚：
- 根据《中华人民共和国道路运输条例》第六十三条，未取得道路运输经营许可，擅自从事道路客运经营，属于非法营运。
- 对于非法营运，违法所得超过2万元的，除责令停止经营外，还需没收违法所得，并处以违法所得2倍以上10倍以下的罚款。
案例应用：
- 在本案例中，个体未取得道路运输经营许可，擅自从事道路客运经营，且违法所得超过2万元，完全符合非法营运的定义。
- 因此，交通运输主管部门依据《中华人民共和国道路运输条例》第六十三条的规定，对该个体进行了相应的处罚，包括没收违法所得和罚款。
三. 结论与建议
- 结论：非法营运被查处后，没收违法所得是常见的处罚措施之一，且通常会根据违法所得的数额来决定罚款的幅度。
- 建议：对于从事道路运输的经营者，务必确保取得合法的道路运输经营许可，以避免因非法营运而面临严厉的行政处罚。同时，对于乘客来说，也应选择正规、合法的运输服务，以保障自身的安全和权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。