针对您提出的“环境污染罪老板指挥员工倒污水，员工会判刑吗”这一问题，我结合相关法律条款和实际情况，给出以下分析：

结论前置：在环境污染罪中，员工是否会被判刑，取决于其在犯罪中的具体角色、对污染行为的知情程度及参与程度。若员工直接参与或明知故犯，且行为对环境污染起到了关键作用，则可能面临刑事责任；反之，若员工不知情或无实际参与，则通常不会承担刑事责任。

详细分析：

1. 员工可能被判刑的情形：

   • 主观故意与客观行为：员工明知公司的排污行为会造成环境污染，却仍然按照老板的指示进行排放，表现出犯罪的故意。例如，明知排放的污水含有有毒物质，仍参与排放活动。
   • 角色与责任：根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，单位犯罪时，其直接负责的主管人员和其他直接责任人员需承担刑事责任。若员工在公司中担任关键角色，如负责排污操作的直接责任人，或明知并积极参与排污决策，则可能面临刑事责任。

2. 员工不会被判刑的情形：

   • 不知情且无参与：员工对公司的排污行为完全不知情，也未参与任何与排污相关的活动。例如，新员工刚入职，对公司的排污行为一无所知。
   • 被胁迫参与且情节轻微：员工在受到胁迫的情况下参与了排污行为，但情节显著轻微且对环境污染的影响较小。在这种情况下，员工可能不会被判刑，但需提供充分证据证明自己是被胁迫且行为情节轻微。

3. 综合判断与司法机关裁量：

   • 在具体案件中，司法机关会根据员工的实际情况进行综合判断，包括其在公司中的职位、对排污行为的知情程度、参与程度以及行为对环境污染的实际影响等。
   • 若员工能够证明自己对公司的排污行为不知情，或虽知情但未积极参与且未起关键作用，则通常可以免除刑事责任。

法律依据：

• 《中华人民共和国刑法（2023修正）》第三百三十八条明确规定了环境污染罪的构成要件及刑罚幅度。
• 《中华人民共和国刑法（2023修正）》第三十一条规定了单位犯罪时，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员的刑事处罚原则。

综上所述，环境污染罪中员工是否会被判刑，需根据其在犯罪中的具体角色、知情程度及参与程度来判断。若您或您身边的人面临此类问题，建议尽快咨询专业律师，以便准确评估法律风险并采取相应措施。