结论前置：如果对方公司存在偷税行为并且已经“跑了”（即逃避法律责任），而你在与该公司的交易中有资金流水记录，一般情况下，只要你自身的行为合法合规，没有参与偷税等违法行为，你的资金流水本身并不会直接导致你承担法律责任。但你可能需要配合税务机关的调查，提供相关证据和材料。
详细分析：
你的法律责任：
- 如果你只是与该公司有正常的业务往来，并且你的交易行为是合法合规的，那么你的资金流水只是证明你与该公司有交易关系，并不会因此承担偷税的法律责任。
- 如果你在交易过程中知道或者应当知道对方公司在偷税，并且你协助或者参与了偷税行为，那么你可能需要承担相应的法律责任。
税务机关的调查：
- 当税务机关发现某公司存在偷税行为时，会展开调查。在调查过程中，税务机关可能会要求与该公司有交易往来的其他公司或个人提供相关证据和材料，包括资金流水记录。
- 你应当积极配合税务机关的调查，提供所需的证据和材料。如果你拒绝配合或者提供虚假信息，可能会面临相应的法律责任。
对你的影响：
- 虽然你的资金流水本身不会直接导致你承担法律责任，但如果你与偷税公司有关联，可能会影响你的商业声誉和信用记录。
- 如果税务机关在调查过程中发现你存在其他违法行为，如虚假开票、逃税等，你将需要承担相应的法律责任。
法律建议：
- 如果你发现自己与偷税公司有交易往来，并且担心可能受到牵连，建议你及时咨询专业律师（即我），了解你的法律风险和应对策略。
- 你应当妥善保管与该公司交易的相关证据和材料，以便在需要时提供给税务机关或律师。
- 如果你被税务机关要求提供协助或配合调查，建议你积极配合，并咨询律师以了解你的权利和义务。