当您的工资被扣2000元时，您可以按照以下步骤来处理这个问题，以确保您的权益得到妥善维护：

第一步：与单位沟通

首先，您应该尝试与单位进行积极沟通，明确了解工资被扣的具体原因。您可以主动联系人力资源部门或直接上级，通过面对面交流或正式的书面函件来表达您的关切。在沟通过程中，您可以提出补发被克扣工资的诉求，并明确指出根据《劳动合同法》的规定，用人单位必须按照合同约定以及国家规定，及时、足额向劳动者支付工资。

第二步：向劳动监察部门投诉

如果单位拒绝给出合理理由或拒绝补发工资，您可以向单位所在地的劳动监察部门投诉。在投诉前，请准备好能证明劳动关系和工资数额的相关材料，如劳动合同、工资条、考勤记录等。劳动监察部门将展开调查，要求单位提供工资支付凭证等资料，并根据调查结果依法处理。

第三步：申请劳动仲裁

如果劳动监察部门的协调未能解决问题，您可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。在申请仲裁时，您需要提交仲裁申请书、相关证据等材料，如工资条、考勤记录、劳动合同等。仲裁委员会将依据这些材料进行公正裁决。请注意，您需要在知道或应当知道自身权利受侵害之日起一年内提出仲裁申请。

第四步：提起诉讼

如果您对仲裁裁决不服，可以在规定期限内向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，请务必保留好所有相关证据，以支持您的主张。

全程保留证据

在整个处理过程中，保留好所有与工资被扣相关的证据至关重要。这些证据将帮助您证明自己的权益，并在必要时支持您的法律诉求。

综上所述，当您的工资被扣2000元时，您应该首先与单位沟通，然后向劳动监察部门投诉，接着申请劳动仲裁，并在必要时提起诉讼。同时，请务必全程保留好所有相关证据，以确保您的权益得到妥善维护。