针对您提出的“摩托车没有行驶证，有合格证发票怎么处罚”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，行驶证是摩托车上路行驶的必备证件，它证明了摩托车的合法身份和上路资格。而合格证和发票虽然能够证明摩托车的来源和购买情况，但并不能替代行驶证的法律地位。
根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，驾驶无行驶证的摩托车上路行驶是违法的，将受到相应的法律处罚。具体来说，处罚可能包括以下几个方面：
罚款：根据法律规定，无证驾驶摩托车可能会被处以罚款，罚款金额因地区而异，但通常会在一定范围内。
扣留车辆：执法部门在发现无证驾驶的摩托车时，有权依法扣留车辆，直至驾驶人提供合法的行驶证或相关证明文件。
行政拘留：在某些情况下，无证驾驶摩托车可能会被视为严重违法行为，驾驶人可能会面临行政拘留的处罚。
对于您提到的有合格证和发票的情况，虽然这些文件能够证明摩托车的合法来源，但并不能免除因无证驾驶而应承担的法律责任。因此，建议您尽快办理摩托车的行驶证，以确保摩托车的合法上路行驶。
此外，我还想提醒您的是，驾驶摩托车时请务必遵守交通法规，确保自身和他人的安全。如果您对具体的法律条款或处罚标准有疑问，建议您咨询当地的交通管理部门或法律专业人士，以获取更准确的信息。
总之，驾驶无行驶证的摩托车是违法的，将受到法律的处罚。建议您尽快办理相关手续，确保摩托车的合法上路行驶。