持有摩托车驾驶证但驾驶无牌照摩托车的，一般会面临行政处罚，具体处罚措施包括罚款、扣分，甚至可能扣留车辆。以下是详细分析：

1. 法律依据与处罚原则
   根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十五条及第九十条，驾驶无牌照机动车上道路行驶属于违法行为。即使驾驶人持有有效驾驶证，仍需承担行政责任。处罚的核心原则是“车证分离”——车辆需依法登记上牌，驾驶人需具备准驾资质，二者缺一不可。

2. 具体处罚措施

   • 罚款：通常处以20元以上200元以下罚款（具体金额由省级公安机关交通管理部门规定，如北京为200元）。
     
   • 扣分：根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，驾驶未悬挂机动车号牌的机动车上道路行驶的，一次记9分。
     
   • 车辆处理：公安机关交通管理部门有权扣留机动车，并通知当事人提供相应的牌证、标志或补办相应手续。若当事人未能提供合法证明或补办手续，车辆可能被依法拍卖或报废。

3. 特殊情形说明

   • 临时牌照：若车辆已申请临时牌照但未悬挂，需同时携带临时牌照纸质凭证，否则仍构成违法。
     
   • 号牌污损/遮挡：若因号牌污损、遮挡导致无法识别，可能被认定为“未按规定安装号牌”，处罚标准与无牌驾驶一致。
     
   • 行政复议：若驾驶人能证明车辆已合法登记（如提供行驶证、购车发票等），可申请行政复议撤销处罚。

4. 风险提示
   无牌驾驶不仅面临行政处罚，若发生交通事故，保险公司可能以“车辆未合法登记”为由拒绝赔付商业险部分，驾驶人需自行承担更高比例的赔偿责任。

建议：驾驶摩托车前务必确保车辆已依法登记上牌，并随身携带行驶证、驾驶证。若车辆未上牌，应尽快到车管所办理注册登记手续。如有其他疑问，可直接向我咨询。