电动摩托车停在机动车位上是否违法，取决于电动摩托车的性质以及停车位的具体规定。

1. 若电动摩托车被归类为机动车：

   • 在这种情况下，电动摩托车理论上是可以停放在机动车停车位的，但需要确保停车位没有明确的禁止标识，且停放方式符合相关规定。

2. 若电动摩托车被归类为非机动车：

   • 根据《中华人民共和国道路交通安全法》的规定，非机动车应当在规定地点停放，未设停放地点的，不得妨碍其他车辆和行人通行。因此，非机动车性质的电动摩托车停放在机动车位上，是违反交通法规的行为。

3. 关于停车位的具体规定：

   • 即使电动摩托车被归类为机动车，也需要仔细查看停车位的标识和规定。如果停车位有明确的指示禁止摩托车停放，或者对停放车辆的类型、尺寸等有具体要求，那么电动摩托车停放在此类停车位上也可能被视为违规。

综上所述，电动摩托车停在机动车位上是否违法，需要根据电动摩托车的性质以及停车位的具体规定来判断。为了避免不必要的法律纠纷和经济损失，建议车主在停车前仔细查看停车位的标识和规定，确保合规停车。如果你对电动摩托车的性质或停车位的规定有疑问，可以向当地交通管理部门咨询或向我提问，我会根据你的具体情况给出更详细的解答。