合同编号应由合同双方当事人约定后，由其中一方进行填写。以下是对此问题的详细分析：
一. 合同编号的填写责任
合同约定：根据合同双方当事人之间的约定，合同编号的填写责任可以明确归属于甲方或乙方。甲方通常指出租方、销售方或服务提供方，而乙方则指承租方、购买方或服务接受方。
实际操作：在实际操作中，合同编号的填写可能由负责合同管理的一方进行，以确保编号的唯一性和规范性。这一方可能是甲方，也可能是乙方，具体取决于双方之间的约定和内部管理规定。
二. 合同编号的编写规则
合同编号的编写规则通常包括以下几个部分：
合同类型代码：根据合同的性质和类别，设置相应的代码，如销售合同可设为“XS”，采购合同设为“CG”等。这有助于对不同类型的合同进行分类和统计。
年份信息：明确合同签订的年份，以体现合同的时效性和历史背景。例如，使用四位数字“2023”表示2023年签订的合同。
序号：为每个合同分配一个唯一的顺序编号，从1开始递增，以区分不同的合同。序号可以确保合同的唯一性和可追溯性。
其他信息：根据企业或组织的需求，合同编号还可能包含公司或组织代码、业务部门代号、合同性质代号等其他信息。这些信息有助于对合同进行更精细化的管理和检索。
三. 合同编号的填写要求
唯一性：合同编号应具有唯一性，以避免混淆和错误。在填写编号时，应确保每个合同都有一个独立的编号。
清晰明了：编号应清晰、易读，避免使用模糊或容易混淆的字符。可以采用数字、字母或两者结合的方式进行编号，使编号具有一定的规律性和可识别性。
记录备案：合同编号应在合同中明确记录，并由合同双方当事人签字或盖章确认。同时，合同的相关文件和资料也应妥善保存，以便日后查阅和管理。
综上所述，合同编号的填写责任应由合同双方当事人约定后确定。在填写编号时，应遵循一定的规则和要求，以确保编号的唯一性、清晰性和可追溯性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。