查封扣押与先行登记保存的主要区别体现在目的、性质、适用依据、实施程序、期限以及法律后果等方面。以下是详细分析：

一. 目的和性质不同

1. 查封扣押：目的是通过对物品的控制，阻止违法行为，防止不法侵害和控制现实危险，以及防止证据毁灭。它是一个独立的具体行政行为，具有可诉性，当事人可提起行政复议或行政诉讼。
2. 先行登记保存：目的是为了保存案件的证据，在证据可能灭失或者以后难以取得的情况下使用。它是行政执法过程中的一种取证手段，是具体行政行为中的一个环节，当事人不可因此申请行政复议和提起行政诉讼。

二. 适用依据和实施主体不同

1. 查封扣押：适用《中华人民共和国行政强制法》以及单行法律、法规的具体规定，必须由具有法律、法规明确授权的行政主体实施。
2. 先行登记保存：依据是《行政处罚法》第56条，只要是具有行政处罚权的行政机关，均可以根据具体情况对证据进行先行登记保存。

三. 实施程序和时间限制不同

1. 查封扣押：程序上较为严格，且期限相对较长，一般不得超过三十日；情况复杂的，经批准可以延长，但延长期限不得超过三十日。
2. 先行登记保存：经行政机关负责人批准后，由执法人员与当事人对证据进行现场清点、造册登记，共同签名确认。它要求7天内必须作出处理决定，对不符合条件的，应立即解除。

四. 针对对象和法律效力不同

1. 查封扣押：针对的是可以用来继续从事违法行为或者造成现实不法危险和侵害的财物、场所和设施等，包括动产和不动产。查封扣押是暂时限制当事人对财物的使用或处分的。
2. 先行登记保存：针对的是可以作为行政诉讼证据证明相对人违法行为的财物和资料，一般情况下是易于移动的动产。先行登记保存期间，当事人或有关人员不得销毁或转移证据，但并不完全限制当事人使用该证据物品。

综上所述，查封扣押与先行登记保存在多个方面存在显著差异。在实际执法过程中，执法人员应根据具体情况灵活选择并严格遵循法定程序和要求，以确保执法的合法性和有效性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。