针对你提出的问题，“公司在运输合同上面写员工是法人代表并让员工自己发出去有效吗”，我的结论是：这样的做法通常是无效的。下面我将从法律角度详细解释这一结论。

1. 法人代表的定义与权限：

   • 法人代表是依法代表法人行使民事权利、履行民事义务的主要负责人。
   • 法人代表的任命和变更通常需要遵循公司章程和相关法律法规的规定，并需要在相关登记机关进行登记。

2. 运输合同中的法人代表条款：

   • 运输合同是双方约定运输权利义务的协议，其中应明确合同双方（通常是托运人和承运人）的身份和地位。
   • 如果合同中错误地将员工列为法人代表，这可能导致合同主体不清，进而影响合同的法律效力。

3. 员工自行发出合同的有效性：

   • 员工并非法人代表，通常没有权限代表公司签署或发出合同。
   • 即使员工在合同上签字并发出，如果未经公司授权或追认，该合同对公司可能不具有约束力。

4. 法律后果与建议：

   • 如果公司想要让员工参与合同签订过程，应明确授权员工的代理权限，并确保合同内容真实、合法、有效。
   • 如果已经出现员工被错误列为法人代表并发出合同的情况，公司应及时与合同相对方沟通，澄清事实，并采取相应的法律措施来纠正错误。

综上所述，公司在运输合同上写员工是法人代表并让员工自己发出去的做法通常是无效的。为确保合同的合法性和有效性，公司应严格遵守相关法律法规和公司章程的规定，正确任命法人代表，并明确员工的代理权限。如果你在这方面有进一步的法律问题或需要具体的法律帮助，请随时向我咨询。