双方对账有差异时，应由对账双方共同确认差异原因并分别或联合出具说明。具体分析如下：

一. 对账差异的处理原则

1. 共同确认：对账是确保双方财务记录一致性的重要手段。当发现对账差异时，首先应由双方共同确认差异的具体内容和金额，以确保后续处理的准确性。
2. 查明原因：双方应通过对账记录、交易凭证等资料，详细查明差异产生的原因，如计算错误、记录遗漏、交易时间差等。
3. 出具说明：根据查明的原因，双方应分别或联合出具对账差异说明，明确差异的具体内容、金额及产生原因，并作为后续处理的依据。

二. 说明的撰写要点

1. 内容准确：说明中应准确描述对账差异的具体情况，包括差异的金额、产生的时间及原因等，确保信息的真实性。
2. 责任明确：如差异由某一方造成，应在说明中明确责任方，以便后续进行责任追究和纠正。
3. 双方确认：说明应由对账双方共同确认并签字盖章，以确保其法律效力。

三. 实际应用中的建议

• 及时沟通：发现对账差异时，双方应及时沟通并协商处理方案，避免差异扩大或影响业务合作。
• 保留证据：对账过程中应保留好相关凭证和记录，以便在出现争议时作为证据使用。
• 定期复核：为确保对账的准确性，双方可定期复核对账结果，及时发现并纠正差异。

我建议，在实际操作中，双方应本着诚信、合作的原则，共同处理对账差异，确保财务记录的准确性和业务的顺利进行。如有进一步需要，您可以继续咨询我。