若农村确权瓦房的主人不知晓房屋被他人卖了，应首先确认买卖合同的效力，并尽快采取法律措施保护自己的合法权益。

一. 确认买卖合同的效力

1. 查看合同是否符合法律规定：根据《民法典》的相关规定，合同的有效性需要满足一定的条件，如合同双方具有相应的民事行为能力，合同内容合法且不违反公序良俗，合同意思表示真实等。若买卖合同存在欺诈、胁迫等情形，可能导致合同无效或部分无效。

2. 考虑无权处分的情况：若卖房人并非房屋的真正所有权人，则其卖房行为属于无权处分。在这种情况下，买卖合同的效力将受到一定影响，需要综合考虑买受人是否善意、是否已支付合理对价、是否已办理过户登记等因素来判断。

• 例如，若卖房人伪造房产证进行交易，且买受人并未进行充分的审查，那么这样的买卖合同很可能被认定为无效。

二. 采取法律措施保护权益

1. 与卖房人协商：若卖房人承认错误并愿意承担责任，双方可以协商解决方案，如恢复原状、赔偿损失等。

2. 向法院提起诉讼：若协商无果，房屋主人可以向法院提起诉讼，请求确认买卖合同的效力，并要求卖房人承担相应的法律责任。在诉讼过程中，房屋主人需要提供充分的证据证明自己的所有权以及卖房人的无权处分行为。

3. 要求赔偿损失：若因卖房人的行为导致房屋主人遭受损失，房屋主人可以在诉讼中一并要求赔偿。赔偿范围通常包括房屋的市场价值、因房屋被卖而产生的其他直接损失以及合理的律师费等。

三. 后续处理建议

1. 及时办理过户登记：若房屋主人成功追回房屋，应尽快办理过户登记手续，确保自己的所有权得到法律认可。

2. 加强房屋管理：房屋主人应加强对房屋的管理和监控，防止类似事件再次发生。

我建议，房屋主人在发现房屋被卖后，应尽快咨询专业律师（如我），了解具体的法律程序和应对策略。同时，也要保留好所有与房屋相关的证据材料，以便在诉讼中能够充分证明自己的权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。