虚开增值税专用发票的处罚管辖一般由犯罪行为地或被告人居住地的公安机关管辖。具体分析如下：

一. 管辖原则

根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释，刑事案件的管辖一般遵循犯罪行为地或被告人居住地的原则。对于虚开增值税专用发票这类经济犯罪，同样适用这一原则。

二. 犯罪行为地

1. 包括虚开行为的实施地：即虚开增值税专用发票的具体地点，如开票地、收票地等。
2. 也包括虚开行为的结果地：如因虚开行为导致税款流失的地点，或虚开行为被发现的地点等。

三. 被告人居住地

1. 一般指被告人的户籍所在地：但如果被告人经常居住地与户籍所在地不一致的，经常居住地也可以视为居住地。
2. 对于单位犯罪：则以其主要办事机构所在地或注册地作为居住地。

四. 特殊管辖情况

1. 如果案件涉及多个地区：且各地区的公安机关都有管辖权时，一般由最初受理的公安机关管辖，或协商确定管辖。
2. 如果案件重大、复杂：或涉及跨地区、跨部门的犯罪，可能需要上级公安机关或专门机关指定管辖。

综上所述，虚开增值税专用发票的处罚管辖一般遵循犯罪行为地或被告人居住地的原则，并考虑特殊管辖情况。如有进一步需要，您可以继续咨询我。