首付款可以由公司账户支付，且此行为是合法的。具体分析如下：

一. 公司账户支付的合法性

1. 公司账户的资金性质：公司账户中的资金属于公司的财产，公司有权根据自身的经营需要，合法、合规地使用这些资金。
2. 支付首付款的法律依据：我国法律并未明确禁止公司账户用于支付首付款。只要支付行为符合公司的经营范围、财务制度和相关法律法规，就是合法的。

二. 公司账户支付首付款的注意事项

1. 确保资金用途合法：公司支付首付款时，应确保该笔资金用于合法的业务往来，如购买商品、服务或投资等。
2. 遵守财务制度：公司应严格按照财务制度进行账务处理，确保资金的流向清晰、合规。
3. 避免税务风险：公司支付首付款时，应关注相关税务规定，确保依法纳税，避免税务风险。

• 例如，一家公司在购买设备时，可以通过公司账户支付首付款给供应商。只要这笔支付符合公司的经营范围和财务制度，且依法纳税，就是合法的。

综上所述，首付款可以由公司账户支付，且此行为是合法的。但公司在支付时，应确保资金用途合法、遵守财务制度和避免税务风险。如有进一步需要，您可以继续咨询我。