工厂扣留劳务合同是不合法的行为。根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议，应当一式两份，劳动者和用人单位各执一份。工厂扣留劳动合同违反了这一法律规定，侵犯了劳动者的合法权益。

关于工厂为什么要扣留劳务合同，可能的原因多种多样，但无论何种原因，都不能成为其扣留合同的正当理由。以下是对这一问题的全面分析：

1. 工厂可能的动机：

   • 管理不善：部分工厂可能由于管理不规范，导致劳动合同管理混乱，从而错误地扣留了劳动者的合同。
   • 意图控制：有些工厂可能试图通过扣留劳动合同来限制劳动者的流动，或者作为对劳动者的一种控制手段。
   • 规避责任：在某些情况下，工厂可能为了规避法律责任，如逃避支付经济补偿金、社会保险等，而故意扣留劳动合同。

2. 劳动者的应对措施：

   • 要求归还：首先，劳动者应明确要求工厂归还扣留的劳动合同，并指出此行为的违法性。
   • 保留证据：在沟通过程中，劳动者应保留相关证据，如谈话记录、邮件往来等，以备后续维权之需。
   • 向劳动监察部门投诉：若工厂拒绝归还，劳动者可向当地劳动监察部门投诉，由劳动监察部门依法进行处理。
   • 申请劳动仲裁或提起诉讼：如劳动监察部门的处理未能满足诉求，劳动者还可申请劳动仲裁或向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。

3. 重要提示：

   • 劳动者应了解自己的法律权益，知道工厂扣留劳动合同是违法的，并勇于维护自己的权益。
   • 在整个维权过程中，保留所有相关证据是至关重要的，这将有助于劳动者证明自己的主张。
   • 如遇复杂情况或需要专业法律帮助，劳动者可直接向我咨询，我将为你提供详细的法律建议和帮助。

综上所述，工厂扣留劳务合同是违法的，劳动者有权要求工厂归还，并可通过多种途径维护自己的合法权益。在维权过程中，劳动者应保留相关证据，并了解可能的法律后果，以便更好地保护自己的权益。