在独栋别墅养鸡是否合法，主要取决于当地的相关法规和政策。以成都市为例，根据《成都市市容和环境卫生管理条例》的相关规定，禁止在中心城区、区(市)县人民政府所在地建成区饲养家禽家畜，这包括独栋别墅在内。因此，在这些区域内养鸡是不合法的。

具体来说：

1. 法规禁止：

   • 《成都市市容和环境卫生管理条例》第三十四条第一款明确规定，禁止在中心城区、区(市)县人民政府所在地建成区饲养家禽家畜和食用鸽。这一规定直接否定了在独栋别墅内养鸡的行为。

2. 处罚措施：

   • 若违反上述规定，根据《成都市市容和环境卫生管理条例》及《四川省城乡环境综合治理条例》的相关规定，将责令限期处理或改正；逾期不处理或改正的，可能面临没收、罚款等处罚。

3. 特殊情况：

   • 虽然一般情况下禁止在独栋别墅内养鸡，但也可能存在特殊情况或特殊规定。例如，某些地区可能因特殊需要（如农业观光、文化传承等）而允许在特定条件下养鸡。因此，在具体情况下，还需查阅当地的相关法规和政策，以确定是否允许养鸡。

综上所述，在独栋别墅养鸡是否合法，需根据当地的相关法规和政策来判断。在大多数情况下，特别是在城市中心或建成区内，养鸡是不被允许的。若您有具体的法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。