关于非法经营医疗器械的处罚，这主要涉及到行政法规以及刑法的相关规定。以下是对此问题的详细解答：
一、行政法规层面的处罚
根据《医疗器械监督管理条例》的相关规定，对于经营、使用无产品注册证书、无合格证明医疗器械的行为，县级以上人民政府食品药品监督管理部门将进行严厉处罚。
没收与罚款：
- 没收违法生产、经营或使用的医疗器械。
- 违法生产、经营或使用的医疗器械货值金额不足1万元的，并处2万元以上5万元以下罚款。
- 货值金额1万元以上的，并处货值金额5倍以上10倍以下罚款。
情节严重时的处理：
- 责令停产停业。
- 由原发证部门吊销医疗器械注册证、医疗器械生产许可证、医疗器械经营许可证。
二、刑法层面的处罚
如果非法经营医疗器械的行为构成犯罪，那么将依据《中华人民共和国刑法》的相关规定进行定罪量刑。
行为界定与定罪标准：
- 未经许可从事第三类医疗器械经营活动的，即构成非法经营行为。
- 非法经营数额在五万元以上，或者违法所得数额在二万元以上的；非法经营医疗器械，造成人身伤害、死亡等严重后果的；具有其他严重扰乱市场秩序的非法经营行为等情形，通常会被认定为非法经营罪。
刑罚处罚：
- 构成非法经营罪的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金。
- 情节特别严重的，处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。
三、处罚流程
对于非法经营医疗器械的处罚流程，一般包括以下步骤：
- 立案阶段：依据监督检查职权或者通过举报、投诉等途径发现的违法行为线索，组织核查并决定是否立案。
- 调查阶段：进行调查取证，案件承办人员不得少于两人，并记录在案。
- 审查阶段：对案件的违法事实、收集的证据等进行审查，提出处理意见。
- 告知阶段：告知当事人享有陈述申辩和要求听证等权力。
- 决定阶段：根据案件审理情况决定是否予以行政处罚，并制作行政处罚决定书。
- 送达阶段：将行政处罚决定书送达当事人。
- 执行阶段：督促当事人履行生效的行政处罚决定，对逾期不履行的申请行政强制执行。
综上所述，非法经营医疗器械的处罚是严厉的，既包括行政法规层面的罚款、没收等处罚措施，也包括刑法层面的定罪量刑。因此，建议相关从业者严格遵守法律法规，确保合法经营。