只盖单位公章未签字的协议在特定条件下是有效的。以下是对此问题的详细分析：

1. 一般情况下的有效性：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这表明，盖章与签字具有同等的法律效力。
   • 公章作为企业对外进行活动的重要代表标识，其使用通常被视为企业对合同内容的认可。因此，在没有特别约定或法律另有规定的情况下，仅盖公章的合同是有效的。

2. 特殊情况下的无效性：

   • 如果合同中明确约定“本合同自双方签字并盖章之日起生效”，那么仅盖公章而未签字的合同将因未满足生效条件而不生效。
   • 如果合同内容存在违反法律法规的强制性规定、损害国家利益、恶意串通损害他人合法权益等情形，即使盖了公章，合同也无效。

3. 其他影响因素：

   • 合同的有效性还取决于其内容是否合法以及当事人的民事行为能力。
   • 在司法实践中，法院会综合考虑合同的具体内容、交易习惯以及各方当事人的真实意思表示等因素来判断合同的效力。

综上所述，只盖单位公章未签字的协议是否有效，需要根据具体情况来判断。如果合同内容合法，且没有违反法律法规的强制性规定，同时也没有特别约定需要签字才生效，那么仅盖公章的协议是有效的。但如果存在上述特殊情况或合同内容不合法，那么协议可能无效。如有需要，您可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更准确的法律意见。