当公司部门解散，涉及到孕妇员工的赔偿问题时，主要应遵循《劳动合同法》以及《女职工劳动保护规定》等相关法律法规。以下是详细的解答：

赔偿原则与标准

1. 经济补偿：

   • 根据《劳动合同法》，公司解散与孕妇解除劳动合同，应按劳动者在本单位工作的年限给予经济补偿。
   • 经济补偿的标准是：每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资。
   • 这里的“月工资”是指劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。

2. 代通知金：

   • 如果公司未提前通知孕妇员工，需额外支付一个月工资作为代通知金。

3. 特殊保护：

   • 根据《女职工劳动保护规定》，孕妇在孕期、产期、哺乳期间享有特殊保护。
   • 如果公司解散导致劳动合同无法履行，且孕妇生育符合计划生育规定，公司应将其工资、生育医疗费用及有关福利待遇等计算至哺乳期满（即孩子一周岁止），并在解除劳动关系时一次性支付给孕妇。

4. 生育保险待遇：

   • 如果公司已为孕妇员工投保生育保险，且孕妇生育符合计划生育规定，那么她应享受生育保险待遇。
   • 生育保险待遇包括生育津贴和生育医疗费用，由生育保险基金支付。孕妇可以持有关生育证明到当地社会劳动保险机构办理手续领取。

劳动仲裁流程

如果孕妇与公司就赔偿事宜协商不成，可以申请劳动仲裁来维护自己的权益。劳动仲裁的流程大致如下：

1. 收集证据：包括劳动合同、工资条、工作证、考勤记录、公司解散通知等，以证明与公司存在劳动关系及自身权益受损情况。

2. 准备仲裁申请书：写明双方信息、仲裁请求（如支付经济补偿等）及事实理由。

3. 提交申请：向有管辖权的劳动争议仲裁委员会提交申请及相关证据材料。

4. 等待受理：仲裁委在收到申请后5日内决定是否受理。若受理，会安排开庭时间并通知双方。

5. 参加庭审：孕妇需按时参加庭审，在庭上陈述主张、出示证据。

6. 接收裁决：仲裁委根据双方陈述和证据作出裁决。若孕妇对裁决不服，可在收到裁决书15日内向法院起诉。

综上所述，公司部门解散时，对于孕妇员工的赔偿应遵循相关法律法规，确保孕妇员工的合法权益得到保障。如果协商不成，孕妇员工可以通过劳动仲裁来维护自己的权益。