请假扣除公司支付的保险费是否合法，取决于具体的法律规定和劳动合同约定。下面我将从几个角度为您详细分析：

1. 法律规定：

   • 根据我国劳动法的相关规定，员工的工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，而保险费通常是用人单位为员工提供的福利待遇之一。因此，除非法律另有规定或劳动合同中有明确约定，否则用人单位不能单方面将保险费从员工的工资中扣除，特别是在员工请假期间。

2. 劳动合同约定：

   • 劳动合同是用人单位与员工之间约定权利义务的重要文件。如果劳动合同中明确规定了请假期间保险费的扣除方式，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位按照劳动合同约定扣除保险费是合法的。

3. 实际情况分析：

   • 在实际操作中，用人单位可能会因为员工请假导致社保缴纳基数变化而调整保险费的承担方式，但这需要事先与员工进行协商，并在劳动合同或相关规章制度中明确约定。如果用人单位未经员工同意就单方面扣除保险费，可能会构成违法行为。

4. 建议：

   • 如果您面临这样的情况，建议首先查看自己的劳动合同和用人单位的相关规章制度，了解保险费扣除的具体约定。如果认为用人单位的扣除行为不合法，可以与用人单位进行沟通协商，或者向当地劳动监察部门投诉举报。

综上所述，请假扣除公司支付的保险费是否合法，需要综合考虑法律规定、劳动合同约定以及实际情况。如果您对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。