对于员工违规参与营利性活动，单位几年后发现有追诉期的问题，其核心在于理解劳动法规中关于用人单位对员工违规行为处理的相关规定。以下是我根据相关法律法规进行的详细解答：

1. 追诉期的概念：

   • 追诉期通常指的是在法律规定的期限内，用人单位有权对员工违规行为进行追究和处理的时效期间。超过这一期限，用人单位可能丧失追究员工违规行为的法律权利。

2. 劳动法规中的追诉期：

   • 在劳动法规中，并没有明确统一规定用人单位对员工违规行为追诉的具体时效期间。这通常取决于用人单位的内部规章制度、劳动合同中的约定，以及相关法律法规的间接规定。

3. 内部规章制度与劳动合同：

   • 用人单位可以在其内部规章制度或劳动合同中明确员工违规行为的追诉期限。如果规章制度或劳动合同中有相关规定，且该规定不违反法律法规的强制性规定，则用人单位应按照该规定执行。

4. 相关法律法规的间接规定：

   • 虽然劳动法规没有直接规定追诉期，但用人单位在处理员工违规行为时，应遵守《劳动法》、《劳动合同法》等相关法律法规的规定。例如，用人单位在处理员工违规行为时，应确保程序合法、证据确凿，并遵循公平、公正的原则。

5. 实际操作中的考虑：

   • 在实际操作中，用人单位在发现员工违规行为后，应尽快进行调查和处理。如果拖延时间过长，可能会导致证据灭失、员工离职等不利情况的发生，从而影响用人单位的合法权益。

6. 建议：

   • 对于用人单位而言，建议在内部规章制度或劳动合同中明确员工违规行为的追诉期限，以确保自身权益得到有效保障。同时，在处理员工违规行为时，应严格遵守相关法律法规的规定，确保程序合法、证据确凿。

综上所述，对于员工违规参与营利性活动，单位几年后发现有追诉期的问题，并没有明确的法律答案。这取决于用人单位的内部规章制度、劳动合同中的约定，以及相关法律法规的间接规定。因此，建议用人单位在处理此类问题时，应综合考虑各种因素，并咨询专业律师的意见。如果你有相关法律问题，可以直接向我提问。