针对“借名买房有协议断供后法院会怎么判”这一问题，以下是一个清晰、详细且有深度的解答：

首先，借名买房断供涉及到实际购房人（借名者）与名义购房人（被借名者）之间的法律关系，以及他们与银行之间的贷款合同关系。在法律层面上，借名买房协议的效力可能会受到质疑。如果该协议被判定为无效，名义购房人将可能需要承担对银行的违约责任，包括清偿所有欠款以及实现抵押权等。

当借名买房出现断供情况时，法院将会根据以下几个方面进行综合性的裁判：

1. 借名买房协议的约定：

   • 如果协议中明确约定了断供责任，法院将按照协议内容判决责任归属。
   • 如果协议中未明确约定断供责任，法院将考虑其他因素来判定责任。

2. 房屋登记与还款义务：

   • 房屋登记在名义购房人名下，因此名义购房人在法律上有义务先偿还银行贷款，以保护自身信用记录。
   • 名义购房人在偿还银行贷款后，有权向实际购房人追偿。

3. 证据与事实审查：

   • 法院将审查借名买房的事实是否成立，包括双方签订的借名买房协议、出资凭证、贷款合同等相关证据。
   • 如果法院认定借名买房事实成立，且实际购房人存在断供行为，法院将判决实际购房人承担偿还责任及相应的违约责任，如支付资金占用利息等。

4. 房屋处置与赔偿：

   • 如果因断供导致房屋被银行处置，名义购房人有权向实际购房人索赔损失。
   • 法院将根据房屋处置的具体情况，以及双方的责任大小，判决实际购房人承担相应的赔偿责任。

综上所述，借名买房有协议断供后，法院的判决将依据借名买房协议的约定、房屋登记与还款义务、证据与事实审查以及房屋处置与赔偿等多个方面进行综合考量。因此，在面临此类问题时，双方应尽快寻求协商解决之道，并妥善保存相关证据，以便更好地保障自身的合法权益。如果协商无果，可以诉诸司法程序，由法院进行公正裁判。