非法占有他人土地是一种侵权行为，当您发现土地被非法占有时，可以按照以下步骤来维护自身权益：

一、初步沟通与协商

首先，尝试与侵权方进行沟通，明确指出其行为的不当之处，并要求对方停止侵害、返还土地并恢复原状。这是最直接且成本最低的解决方式。如果双方能够达成和解，那么问题就可以在此阶段得到解决。

二、申请基层组织调解

如果协商不成，您可以向当地的基层组织（如村委会、居委会等）申请调解。基层组织会了解双方的情况，并尝试从中斡旋，促使双方达成和解。调解的好处在于它能够提供一个相对中立的第三方平台，帮助双方找到共同的解决方案。

三、提起民事诉讼

如果调解也无法解决问题，那么您可以向法院提起民事诉讼。在诉讼过程中，您需要提供土地权属证明等相关证据，以证明土地归您所有或使用。法院会依据事实和法律，判决侵权方承担责任，如返还土地、赔偿损失等。需要注意的是，诉讼过程可能会相对复杂和耗时，但它是维护您合法权益的有效途径。

四、可能的行政和刑事责任

除了民事责任外，非法占有土地还可能涉及行政和刑事责任。从行政法的角度来看，县级以上的人民政府自然资源主管部门有权责令非法占用土地的人退还土地，并可能对违规建筑进行拆除或没收。如果非法占用土地的情节特别严重，还可能触犯刑法中的非法占用农用地罪等罪名，面临刑事处罚。

五、赔偿与处置

如果侵权方被判定承担责任，您有权要求其赔偿因非法占用行为导致的经济损失。赔偿的范围和标准通常会根据实际情况进行确定，包括但不限于土地租金、恢复土地原状所需的费用等。同时，对于侵权方在土地上进行的违规建设，法院或相关部门也会根据具体情况进行处置。

综上所述，当您发现土地被非法占有时，应首先尝试与侵权方进行沟通协商；如果协商不成，可以向基层组织申请调解；如果调解仍无法解决问题，则可以向法院提起民事诉讼来维护自身权益。在整个过程中，您应保留好相关证据，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议和支持。