关于营运车辆交通事故赔偿的问题，这是一个涉及多个法律层面和实际操作步骤的复杂议题。以下是我根据相关法律法规和司法实践，为您提供的详细解答：
一、核心结论
营运车辆交通事故赔偿需依据《民法典》、《道路交通安全法》等法律法规，首先确定事故责任，然后根据责任比例、保险情况及特殊情况综合考虑赔偿。赔偿范围包括直接损失（如车辆维修费、货物损失）和间接损失（如停运损失）。
二、赔偿步骤与责任主体
确定事故责任：
- 交通事故责任认定是基础，由交管部门根据当事人行为对事故发生的作用及过错严重程度划分责任。
赔偿顺序：
- 无责时：对方交强险限额内赔偿，不足部分按责由对方商业险或个人财产赔偿。
- 有责时：交强险限额内赔偿对方，商业险依合同及责任比例赔偿。若交强险和商业险均不足，由肇事方个人或单位承担剩余赔偿。
特殊责任主体：
- 若司机是受雇于公司，属职务行为，营运公司承担赔偿责任；若司机有故意或重大过失，公司赔偿后可向司机追偿。
- 若涉及多方责任，按责任比例分担赔偿。
三、停运损失赔偿
- 停运损失可依实际停运时间和营运收入减少情况主张赔偿，需提供相关证据证明营运收入及停运时间。
- 计算方法可通过司法鉴定确定具体数额，或提供近期营运收入记录、税务证明等作为证据。若无法提供，可参考当地同行业平均收入标准。
四、保险公司责任
- 交强险在责任限额内赔偿第三方的人身伤亡和财产损失。
- 商业第三者责任险按保险合同约定进行赔偿，超出部分由营运车一方根据事故责任比例承担。
五、特殊情况处理
- 肇事方逃逸或未投保：由肇事方自行承担或通过其他途径解决。
- 被侵权人有过错：根据“与有过失”制度，减轻侵权人的赔偿责任。
- 挂靠车辆：挂靠人和被挂靠人承担连带责任。
六、争议解决途径
- 双方可通过协商、调解或诉讼等途径解决争议。
- 在诉讼过程中，可委托法院进行司法鉴定以确定营运损失的具体数额。
综上所述，营运车辆交通事故赔偿问题涉及多个方面，包括事故责任认定、赔偿顺序、停运损失赔偿、保险公司责任以及特殊情况处理等。在实际操作中，应综合考虑各种因素，确保赔偿结果的公平合理。如有任何具体问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。