在亲子鉴定中，三联体39个基因座的匹配情况是一个复杂的科学问题，它涉及到遗传学、分子生物学等多个领域的知识。不过，从法律的角度来看，我们可以这样理解：

结论前置：生父在亲子鉴定中，理论上会在三联体39个基因座上都能和孩子匹配上，因为孩子的一半遗传物质来自生父。而疑父则不一定，除非他确实是孩子的生父，否则不会在所有基因座上都与孩子匹配。

详细解释：

1. 生父与孩子的基因匹配：

   • 生父是孩子的生物学父亲，因此孩子会从生父那里继承一半的遗传物质。
   • 在亲子鉴定中，如果使用的是三联体（即孩子、生父、母亲或另一疑似生父）的检测方式，并且检测方法准确可靠，那么生父在39个基因座上都应该能与孩子匹配上。

2. 疑父与孩子的基因匹配：

   • 疑父是指被怀疑可能是孩子生父的人。
   • 如果疑父确实是孩子的生父，那么他在39个基因座上也应该能与孩子匹配上。
   • 但如果疑父不是孩子的生父，那么他在某些或全部基因座上就不会与孩子匹配。

3. 亲子鉴定的准确性和局限性：

   • 亲子鉴定是一项科学的检测，其准确性受到多种因素的影响，如检测方法的灵敏度、样本的质量、检测人员的专业水平等。
   • 尽管三联体亲子鉴定在理论上具有很高的准确性，但也不能完全排除误差或特殊情况的存在。

4. 法律建议：

   • 如果你对亲子关系有疑虑，建议通过正规的亲子鉴定机构进行鉴定。
   • 在选择鉴定机构时，应了解其资质、信誉和专业水平。
   • 鉴定结果出来后，如果涉及法律纠纷或权益分配，可以寻求专业律师的帮助来解读结果并维护自己的合法权益。

综上所述，生父在亲子鉴定三联体39个基因座上理论上都能和孩子匹配上，而疑父则不一定。如果你对此有进一步的法律问题或需要更详细的解释，可以直接向我咨询。