工伤认定书下来之后等待三个月的情况，并非是一个固定的流程或规定，而可能是由于多种因素导致的。以下是一些可能的原因：

首先，工伤认定的流程本身可能存在一定的处理时间。尽管相关部门会尽力在规定的时限内完成工伤认定，但实际操作中可能会因申请材料不完整、需要进一步调查核实等情况而延长处理时间。此外，不同地区的工伤认定流程和时间也可能存在差异，这可能导致等待时间的不同。

其次，等待三个月可能与工伤认定的后续流程有关。在工伤认定书下发后，受伤员工可能需要进一步接受医疗治疗、进行康复等，这些过程都需要时间。同时，用人单位和受伤员工也需要根据工伤认定书的结果来处理相关的工伤赔偿、安置等事宜，这些也可能需要一定的时间。

另外，如果工伤认定过程中存在争议或需要进一步的法律程序，比如申请行政复议或提起行政诉讼等，这也会导致等待时间的延长。在这些情况下，相关部门需要等待法律程序的结果才能继续处理工伤认定相关事宜。

最后，还需要考虑到一些特殊情况，比如节假日、系统故障等不可抗力因素，这些都可能对工伤认定的处理时间产生影响。

综上所述，工伤认定书下来之后等待三个月并不是固定的规定或流程，而是可能由于多种因素导致的。如果您对等待时间有疑问或担忧，建议您及时咨询相关部门或专业人士，以获取更准确的信息和帮助。