针对“违反停业整顿的场所怎么处罚”这一问题，具体的处罚措施会依据违反的法规、违规行为的性质以及违规场所的类型而有所不同。以娱乐场所为例，根据《娱乐场所管理条例》的相关规定，我可以为您提供一个详细的解答。
一、处罚依据
《娱乐场所管理条例》（2006年公布，后经多次修正）是规范娱乐场所经营活动、维护娱乐场所秩序、保障消费者和从业人员合法权益的重要依据。该条例对娱乐场所的违规行为设定了明确的法律责任，包括警告、罚款、停业整顿以及吊销娱乐经营许可证等。
二、停业整顿的处罚情形
根据《娱乐场所管理条例》第五十三条第三款的规定，娱乐场所因违反本条例规定，在2年内被处以3次警告或者罚款后，再次违反本条例的行为应受行政处罚的，由县级人民政府文化主管部门、县级公安部门依据法定职权责令停业整顿。停业整顿的期限一般为3个月至6个月。
三、进一步处罚
如果娱乐场所在2年内被2次责令停业整顿后，再次违反本条例的行为应受行政处罚的，那么情况将更为严重。此时，由原发证机关吊销其娱乐经营许可证，这意味着该娱乐场所将失去合法经营的资格。
四、处罚程序
立案阶段：公安机关在检查中发现或者接到举报、控告的违法案件，或者移送的此类违法案件，需要行政处罚的，会予以审查，决定是否立案。
调查阶段：对于立案的案件，公安机关会派出至少两名执法人员进行调查，并确保执法人员与当事人无直接利害关系。调查时会出示执法证件，并允许当事人辩解陈述。
审查阶段：公安机关会对违法嫌疑人的基本情况、案件事实、证据、案件定性、法律适用、办案程序等方面进行全面审查，并提出处理意见。
告知阶段：在作出行政处罚决定前，公安机关会告知违法嫌疑人拟作出行政处罚决定的事实、理由及依据，并告知其依法享有陈述权和申辩权。
决定阶段：公安机关会制作行政处罚决定书，载明违法事实和证据、处罚依据和内容、申请行政复议或提起行政诉讼的途径和期限等内容。
送达阶段：行政处罚决定书会在7日内送达当事人。
执行阶段：如果当事人逾期不履行行政处罚决定，公安机关会采取加罚、申请人民法院强制执行等措施。
综上所述，对于违反停业整顿规定的场所，相关部门会依据法律法规进行严格的处罚，以确保市场的规范运营和消费者的合法权益。同时，也提醒所有经营者要严格遵守相关法律法规，避免违规行为带来的不良后果。