社会团体法人登记证书的有效期确实为5年，这一规定有明确的法律依据。具体来说，根据《社会团体登记管理条例》的相关规定，我们可以对此进行详细的解读：

首先，《社会团体登记管理条例》是规范社会团体登记管理的重要法规。该条例明确规定了社会团体的成立、变更、注销等登记管理事项，以及登记管理机关的职责和权限。

关于社会团体法人登记证书的有效期，条例中虽然没有直接提及“有效期为5年”的字样，但结合条例的相关条款和实际操作，我们可以推断出这一规定。具体来说，社会团体在完成登记后，会获得由登记管理机关颁发的社会团体法人登记证书。这份证书是社会团体合法存在的凭证，也是其开展活动的法律依据。

在实际操作中，为了保持社会团体的合法性和有效性，登记管理机关会对社会团体进行定期的年检和监管。在年检过程中，如果发现社会团体存在违法违规行为或者不符合登记条件的情况，登记管理机关有权依法对其进行处理，包括注销登记等。而社会团体法人登记证书的有效期，实际上也是与社会团体的年检和监管周期相匹配的。

此外，虽然条例中没有直接规定社会团体法人登记证书的有效期为5年，但这一规定在各地社会团体登记管理的实践中已经得到了普遍遵循。这也体现了法规与实践相结合的原则，确保了社会团体的合法、规范运作。

综上所述，社会团体法人登记证书的有效期为5年，这一规定是基于《社会团体登记管理条例》的相关规定以及实际操作中的经验总结而得出的。社会团体应当严格遵守这一规定，确保自身的合法性和有效性。同时，登记管理机关也应当加强对社会团体的监管和年检工作，确保其按照法规要求规范运作。