公司注册资本借款是否合法，取决于借款的具体情况和用途。下面我将从几个角度详细解释这个问题：
股东与公司之间的借款：
- 股东向公司借款是合法的，但通常有限额，即不允许超过股东个人投资注册资本的两倍。如果超出这个限额，产生的利息就不能扣除所得税。例如，如果股东投资到公司的注册资本是100万，那么他最多只能向公司借款200万，超出部分将需要缴纳相应的所得税。
- 借款利率也不能超过银行同期的贷款利率，超出部分同样不能扣除所得税，并且法律不予保护。
公司资金借贷给他人的规定：
- 根据《中华人民共和国公司法》第一百四十九条，董事、高级管理人员不得违反公司章程的规定，未经股东会、股东大会或者董事会同意，将公司资金借贷给他人或者以公司财产为他人提供担保。这意味着，公司资金借贷给他人是需要严格遵循公司内部决策程序的，否则可能构成违法行为。
公司注册资本的用途：
- 公司注册资本是公司设立时股东认缴的出资额，用于公司的经营和发展。在正常情况下，注册资本不应被用于非经营性的借贷。但如果公司因经营需要，且符合公司内部决策程序和法律法规的要求，那么在一定条件下，公司可以将其闲置的资金（包括注册资本的一部分）用于合法的借贷活动。
综上所述，公司注册资本借款的合法性取决于多个因素，包括借款的具体情况、用途以及是否遵循了公司内部决策程序和法律法规的要求。因此，在进行借款操作前，建议公司咨询专业律师或财务顾问，以确保借款活动的合法性和合规性。如果你有更具体的问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。