法人独资的法人公司借款是否合法，需根据借款的具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

一、借款主体与性质

1. 法人公司作为借款主体：

   • 法人公司作为独立的法律主体，有权进行民事活动，包括借款。因此，从主体资格上看，法人公司借款是合法的。

2. 借款性质：

   • 如果借款是用于公司的正常经营、投资或发展等合法目的，且符合公司章程和法律法规的规定，那么这种借款是合法的。
   • 如果借款是用于非法目的，如赌博、洗钱等，或者违反了公司章程或法律法规的规定，那么这种借款就是非法的。

二、借款程序与合规性

1. 内部决策程序：

   • 法人公司借款通常需要经过公司内部的决策程序，如董事会或股东会的决议。如果借款未经适当的内部决策程序，可能构成对公司治理结构的违反，但并不直接导致借款行为本身非法。然而，在极端情况下，如借款行为严重损害公司利益且未经合法程序，可能涉及违法甚至犯罪行为。

2. 合规性审查：

   • 借款行为应符合相关法律法规的规定，如《中华人民共和国公司法》、《中华人民共和国民法典》等。例如，借款利率应合理，不得超过法定上限；借款合同应合法有效，明确双方的权利和义务等。

三、借款用途与资金流向

1. 借款用途：

   • 借款应明确用于公司的合法经营或投资活动。如果借款被用于非法目的或个人消费等非公司经营用途，可能构成对公司财产的挪用或侵占，从而引发法律问题。

2. 资金流向：

   • 借款资金应按照合同约定的用途使用，并接受公司的财务监督和审计。如果资金流向不明或存在违规操作，可能涉及财务违规或违法行为。

四、法律后果与风险

1. 合法借款的法律后果：

   • 如果借款行为合法合规，公司应按照合同约定履行还款义务。如果公司无法按时还款，可能面临违约责任和信用风险。

2. 非法借款的法律后果：

   • 如果借款行为非法或违规，公司可能面临法律制裁和行政处罚。同时，相关责任人也可能承担个人法律责任，如罚款、拘留甚至刑事责任。

五、具体建议

1. 完善内部决策程序：

   • 确保借款行为经过公司内部的适当决策程序，如董事会或股东会的决议，并保留相关会议记录和决议文件。

2. 明确借款用途和资金流向：

   • 在借款合同中明确借款用途和资金流向，并确保资金按照合同约定使用。同时，加强公司的财务监督和审计工作，确保资金使用的合规性和透明度。

3. 遵守相关法律法规：

   • 确保借款行为符合相关法律法规的规定，如借款利率、合同形式等。如有需要，可以咨询专业律师或法律机构进行合规性审查。

4. 建立风险防控机制：

   • 建立完善的风险防控机制，对借款行为进行风险评估和监控。一旦发现潜在风险或问题，应及时采取措施进行应对和解决。

总结来看，法人独资的法人公司借款是否合法取决于借款的具体情况。为确保借款行为的合法性和合规性，公司应完善内部决策程序、明确借款用途和资金流向、遵守相关法律法规并建立风险防控机制。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。