停薪留职的医务人员现在是可以注册医疗机构的。

这一结论是基于对相关法律法规的修订内容的理解。具体来说，国家卫生计生委在其官网发布了《关于修改〈医疗机构管理条例实施细则〉的决定》，其中删除了“医疗机构在职、因病退职或者停薪留职的医务人员不得申请设置医疗机构”的内容。这一修改意味着，停薪留职的医务人员现在具备了申请设置医疗机构的资格。

从实际操作的角度看，停薪留职的医务人员在申请注册医疗机构时，需要满足一系列的条件和要求，包括但不限于具备相应的医疗技术和管理能力、有符合规定的场所和设施、有充足的经费来源等。同时，他们还需要按照相关的程序和要求进行申请和审批，以确保医疗机构的合法性和规范性。

总之，停薪留职的医务人员现在是可以注册医疗机构的，但在具体操作过程中需要遵守相关的法律法规和程序要求。如果你有更具体的问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。