如果您的个体工商户营业执照正本和食品许可证遗失了，您需要尽快采取措施进行补办，以确保您的业务能够正常运行。

首先，对于营业执照正本的遗失，您应该立即在国家企业信用信息公示系统填报营业执照遗失作废声明，然后准备相关材料前往市场监督管理局窗口进行补领。在办理补领手续时，您可能需要提供经营者的身份证复印件以及其他所需材料，具体要求可以咨询当地市场监督管理局。

至于食品许可证的遗失，处理流程可能因地区而异。一般来说，您也需要先发布遗失声明，然后向当地食品药品监督管理部门申请补办。在申请补办时，您可能需要填写相关表格，并提交身份证明和经营场所的证明材料等。

请注意，这些证照的遗失可能会对您的业务产生影响，因此在补办期间，您可能需要采取一些临时措施来确保业务的正常运行，例如向客户提供解释说明，或者暂时停业等待新证照的办理。

另外，为了防止类似事件的再次发生，建议您在日常经营中加强证照的管理和保管，确保它们的安全和完整性。

总的来说，虽然证照的遗失可能会带来一些麻烦，但只要您及时采取措施进行补办，并加强证照的管理，就能够将影响降到最低。