事业单位人员经商，如果违反了相关规定，其经营所得确实存在被没收的风险。下面我将从几个角度详细解释这个问题：

1. 法律规定：

   • 根据《中华人民共和国公务员法》等相关法律法规，公务员及事业单位人员通常被要求专职专责，不得从事与职务无关的商业活动。这是为了保持公职人员的廉洁性，防止利用职权谋取私利。
   • 如果事业单位人员违反了这些规定，从事了经商活动，并且被相关部门查处，那么其经营所得很可能会被视为违法所得，从而面临被没收的风险。

2. 实际情况分析：

   • 事业单位人员经商的情况比较复杂，有些可能是在业余时间进行的小规模经营，有些则可能涉及大规模的商业活动。
   • 对于那些小规模、偶尔的经营活动，如果未对公职产生不良影响，相关部门可能会采取较为宽容的态度。但一旦经营活动规模较大，或者涉及到了利用职权谋取私利，那么就很可能面临严厉的处罚，包括经营所得的没收。

3. 法律建议：

   • 作为事业单位人员，应当严格遵守相关法律法规，避免从事与职务无关的商业活动。
   • 如果确实有需要从事商业活动的情况，应当先咨询相关部门或法律专业人士，确保自己的行为符合法律法规的要求。
   • 如果已经从事了经商活动，并且担心可能面临法律风险，建议尽快咨询专业律师，了解具体的法律后果和应对策略。

综上所述，事业单位人员经商如果违反了相关规定，其经营所得确实存在被没收的风险。因此，建议事业单位人员务必遵守相关法律法规，避免不必要的法律风险。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。