患者要求封存原始病历，医院却封存了复印件，这种做法是违法的。

首先，根据《医疗纠纷预防和处理条例》以及《医疗事故处理条例》的相关规定，发生医疗纠纷时，医疗机构应当告知患者或者其近亲属有关病历资料、现场实物封存和启封的规定。若需要封存、启封病历资料，应当在医患双方在场的情况下进行。封存的病历资料可以是原件，也可以是复制件，但必须由医疗机构保管。这一规定确保了病历资料的真实性和完整性，以便在后续的医疗纠纷处理中作为重要证据。

其次，医院在患者要求封存原始病历的情况下，却封存了复印件，这一行为违反了上述规定。因为复印件可能无法完全反映原始病历的所有内容，特别是对于一些细微的笔迹、修改痕迹等，复印件可能无法清晰展现。这就给病历资料的真实性和完整性带来了隐患，也可能对后续的医疗纠纷处理产生不利影响。

因此，医院应当严格按照规定，在患者要求封存病历时，封存原始病历资料，并确保其真实性和完整性。如果医院违反了这一规定，患者或其近亲属可以向县级以上人民政府卫生主管部门投诉，要求医院承担相应的法律责任。

总之，医院在患者要求封存原始病历的情况下，却封存了复印件，这种做法是违法的。患者应当积极维护自己的合法权益，要求医院按照规定封存原始病历资料。