单位缴纳的大额医疗保险不计入个人所得税应纳额。以下是详细解释：

在我国，个人所得税的计税依据是纳税人取得的各项应税所得，包括工资、薪金所得，劳务报酬所得，稿酬所得，特许权使用费所得，经营所得，利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得，偶然所得等。而单位为员工缴纳的社会保险费用，包括基本医疗保险、大额医疗保险等，通常不计入员工的个人所得，因此也不需要缴纳个人所得税。

具体来说，根据《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例的规定，单位为个人缴付和个人缴付的基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、住房公积金，以及单位为员工缴纳的大额医疗保险等，均可以从纳税人的应纳税所得额中扣除，即不计入个人所得税的计税依据。

因此，单位缴纳的大额医疗保险不计入个人所得税应纳额，这是有明确的法律依据的。如果你在这方面还有其他疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。