关于“医保停三个月会清零吗”的问题，这主要取决于具体的医保政策和地区规定。以深圳市为例，根据《深圳市医疗保障办法》的规定，参保人在一个医疗保险年度内累计中断参保不超过3个月的，重新缴费后，中断前后的连续参保时间可以合并计算。然而，如果中断超过3个月，连续参保时间则需要重新计算。这意味着，虽然医保不会完全“清零”，但连续缴费年限会受到影响，可能会影响到报销比例等医保待遇。

此外，一些地区如内蒙古，从2025年起实施了医保等待期新规。断缴后不仅会有3个月的固定等待期，每多断1年还要再加1个月，断4年以上的最多要等半年才能恢复报销。这样的规定进一步强调了连续缴费的重要性。

因此，为了避免医保待遇受到影响，建议参保人尽量保持医保的连续缴费。如果确实因为某些原因中断了缴费，也应尽快补缴，以缩短中断时间，保持医保的连续性。同时，换工作或退休前，也应做好社保的衔接和规划，确保医保待遇不受影响。

总的来说，医保停三个月是否会“清零”取决于具体的医保政策和地区规定，但连续缴费年限肯定会受到影响。因此，参保人应密切关注医保政策的变化，合理规划自己的社保缴费，以确保享受到应有的医保待遇。